流动人口是结核病防治工作的特殊人群和重点人群。调查显示，随着城市化进程的不断加快，大量农村人口涌入城市形成流动人口，这类人群营养条件较差，经济困难，卫生状况不良，对肺结核防治知识、国家减免政策了解不足，结核病发病率、患病率均明显高于市区常住居民；且由于流动人口在不同城市和地区频繁迁徙，极易中断治疗造成结核病的反复迁延和快速传播，更给结防机构的治疗管理工作造成极大的困难。

深圳市70%人口为流动人口，结控工作难度和重要性远远超过内地。针对这一难题，南山区2002年启动“广东省结核病控制项目”， 在国内率先将非户籍人口纳入项目管理，使其享受与户籍人口平等的结核病政策、免费检查和治疗管理。2006年启动实施国家重点项目“全球基金流动人口结核病防治项目”，为流动人口实施多项先进技术策略，提供十分优惠的政策和关爱服务，主要包括：发放交通、营养费用缓解患者的经济困难，鼓励患者坚持治疗；积极联系外省结防机构帮助肺结核患者落实返乡治疗，衔接后续管理和服务；为外地患者电话通知检查结果；与非政府组织（NGO）合作为流动人口开展结核病宣传倡导活动等。2011年启动实施中国全球基金流动人口结核病整合项目，全面开展个体化心理支持工作，为流动人口肺结核患者纠正不良情绪状态和错误健康观念，改善治疗依从性和生活质量，从而在人文关怀层面加强治疗管理，提升治疗效果。

迄今，南山慢病院已为流动人口肺结核患者发放交通、营养费数十万元，落实返乡后续治疗300余例，与NGO合作开展宣传活动十余次，开展个体心理支持服务逾百次。各项优惠政策的实施，为流动人口肺结核患者得到全程、彻底的治疗提供了充分的保障，为实现南山区结核病疫情的有效控制起到了强有力的推动作用。