1.细菌学检查阳性是确诊的依据。若痰菌阴性可行气管镜下刷检及支气管肺泡灌洗液抗酸杆菌及结核分枝杆菌培养提高阳性率；

2.继发型肺结核据临床表现、胸部X线表现、排除其他非结核肺部疾患、抗结核治疗有效，可以诊断。PPD强阳性、血清抗结核抗体阳性、痰或支气管肺泡灌洗液等PCR阳性或肺外组织病理证实为结核病变，均可作为诊断参考；

3.继发型肺结核表现为多种形态，需注意与各类细菌性或非细菌性肺炎、肿瘤等相鉴别；

4.非结核分枝杆菌肺病在临床症状、X线表现上与肺结核相似，涂片检查也难以区别，只能依据菌种鉴定来鉴别；

5.常可合并结核性胸膜炎、气胸、细菌感染；慢性纤维空洞患者可继发曲菌感染等。