精神卫生科成立于2006年，科室成立至今开展了多项国家、省、市继教项目，积累了丰富的继教项目工作经验，为科研实施工作提供了扎实的基础。同时，科室学科能力建设持续加强。

2018年科室依托中山大学公共卫生学院和加拿大多伦多大学共同申报国自然国际（地区）重点合作项目《基于队列的抑郁症规范化防治及管理的实施性研究》，并获500万元资助，项目实施至今在南山区84家社康率先开展社区抑郁症筛查、转诊、随访、治疗等工作，致力于探索建立社区抑郁症规范化防治管模式；2019年南山区第三轮重点学科建设中，精神卫生科被评为南山区A级重点学科；2019年第一批区域学科联盟建设评审工作中，获批阳光心情区域学科联盟；2022年精神卫生科获“南山区医疗卫生三名工程”为期5年共1000万的资助，引进了国家精神心理疾病临床医学研究中心李凌江教授团队；同年，作为区级精神卫生中心参与国家科技创新2030 “脑科学与类脑研究”重大项目“抑郁症的社区人群队列研究项目”，构建抑郁社区人群队列；2023年根据项目经验撰写的《深圳南山模式：基于社区的抑郁症特色防治路径探索》获全国社会心理服务体系建设优秀案例。

科室自建立以来，共承担课题13项，其中国自然1项，市级课题4项，区级课题8项；发表论文36篇，其中SCI论文10篇，中华牌1篇，统计源杂志10篇，著作3本。期间，与中山大学公共卫生学院联合培养公共卫生博士研究生2人，科室荣获“2017年度广东省严重精神障碍管理治疗工作先进县区”；连续8年区级精神卫生机构绩效评估全市第一。